Le coronavirus contient des «insertions de VIH», alimentant les craintes liées aux armes biologiques créées artificiellement
Cellule44 : Cet article qui pour certain pourrait sentir la théorie conspirationniste à plein nez, est en fait une déclassification des services américains voir ici : https://linktr.ee/kagbabe (le lien a été supprimé le 19.01.2021 comme par hasard)
Mais bon …à vous de vous informer, on ne sait jamais……
Mise à jour (1040ET): La science évolue rapidement pendant une épidémie comme celle-ci, et le Dr Feigl-Ding a publié quelques tweets clarifiant et corrigeant certaines des informations citées dans les fils que nous avons inclus ci-dessous.
25. SUIVI RAPIDE: Un chercheur @trvrb a fait une recherche BLAST et a trouvé les insertions existantes dans d’autres virus apparentés. Attendons de voir des études plus confirmées / réfutantes à publier. https://t.co/cbMoLnlecI https://t.co/XGqytnNnIU
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
Bien qu’à l’avance, il a reconnu que les conclusions de l’article sont sauvages et doivent être immédiatement examinées par la communauté scientifique.
23. Apparemment, je ne suis pas le seul à penser que la conclusion de cet article est “chauve-souris” sauvage (pardonnez le jeu de mots). Nous devons reproduire cette étude maintenant avant que le monde ne devienne fou. Arrêtons-nous tous et retenons notre souffle s’il vous plaît 😷. https://t.co/Vrjcn9FCm7 https://t.co/wHJIcXZ4PA
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
La situation est fluide. Qui sait ce que les chercheurs découvriront ensuite?
* * *
Au cours des derniers jours, la presse grand public a vigoureusement repoussé une théorie sur les origines du coronavirus qui a maintenant infecté plus de 70000 personnes à Wuhan seulement (selon qui vous croyez). La théorie est que la Chine a obtenu le coronavirus via un programme de recherche canadien et a commencé à le transformer en arme biologique à l’Institut de virologie de Wuhan. Politifact a pointé du doigt Zero Hedge, en particulier, bien que l’histoire ait été largement partagée dans les médias indépendants.
La théorie est que le virus, qui a été développé par des experts en maladies infectieuses, pourrait provenir du laboratoire basé à Wuhan du Dr Peng Zhou , le principal chercheur chinois sur le système immunitaire des chauves-souris, en particulier sur la façon dont leur système immunitaire s’adapte à la présence de virus comme coronavirus et autres virus destructeurs. D’une manière ou d’une autre, le virus s’est échappé du laboratoire et le marché aux poissons du Hunan, où le virus est supposé être originaire, n’est qu’une ruse.
Maintenant, un épidémiologiste respecté qui a récemment attrapé un flack pour avoir affirmé dans une menace Twitter que le virus semblait être beaucoup plus contagieux qu’on ne le croyait initialement, souligne des irrégularités dans le génome du virus qui suggèrent qu’il aurait pu être génétiquement modifié à des fins d’arme, et pas n’importe quelle arme mais la plus meurtrière de toutes.
Dans “Une similitude étrange des inserts uniques dans la protéine de pointe 2019-nCoV avec le VIH-1 gp120 et Gag “, les chercheurs indiens sont déconcertés par des segments de l’ARN du virus qui n’ont aucun rapport avec d’autres coronavirus comme le SRAS, et semblent plutôt VIH. Le virus répond même au traitement par les médicaments anti-VIH.
Pour ceux qui sont pressés par le temps, voici les principales conclusions de l’article, qui se concentre d’abord sur la nature unique du 2019-nCoV, puis observe quatre séquences d’acides aminés dans le coronavirus de Wuhan qui sont homologues aux séquences d’acides aminés du VIH1:
Notre arbre phylogentique des coronavirus pleine longueur suggère que le 2019-nCoV est étroitement lié au SRAS CoV [Fig1].
En outre, d’autres études récentes ont lié le 2019-nCoV au SARS CoV. Nous avons donc comparé les séquences de glycoprotéines de pointe du 2019-nCoV à celles du SARS CoV (numéro d’accès NCBI: AY390556.1). Après un examen attentif de l’alignement des séquences, nous avons constaté que la glycoprotéine de pointe 2019-nCoV contient 4 insertions [Fig.2]. Pour étudier plus en détail si ces inserts sont présents dans tout autre virus corona, nous avons effectué un alignement de séquences multiples des séquences d’acides aminés de la glycoprotéine de pointe de tous les coronavirus disponibles (n = 55) [voir le tableau S.File1] dans NCBI refseq (ncbi.nlm .nih.gov), cela inclut une séquence de 2019-nCoV [Fig.S1]. Nous avons constaté que ces 4 insertions [inserts 1, 2, 3 et 4] sont uniques au 2019-nCoV et ne sont pas présentes dans les autres coronavirus analysés. Un autre groupe de Chine avait documenté trois insertions comparant moins de séquences de glycoprotéines de pointe de coronavirus. Un autre groupe de Chine avait documenté trois insertions comparant moins de séquences de glycoprotéines de pointe de coronavirus (Zhou et al., 2020).
Nous avons ensuite traduit le génome aligné et constaté que ces inserts sont présents dans tous les virus Wuhan 2019-nCoV à l’exception du virus 2019-nCoV de Bat en tant qu’hôte [figure S4]. Intrigués par les 4 inserts hautement conservés uniques au 2019-nCoV, nous avons voulu comprendre leur origine. À cette fin, nous avons utilisé l’alignement local 2019-nCoV avec chaque insert comme requête contre tous les génomes de virus et avons considéré les hits avec une couverture de séquence de 100%. De manière surprenante, chacun des quatre inserts s’alignait sur de courts segments des protéines du virus de l’immunodéficience humaine 1 (VIH-1) . Les positions des acides aminés des inserts dans 2019-nCoV et les résidus correspondants dans HIV-1 gp120 et HIV-1 Gag sont indiquées dans le tableau 1.
Les 3 premiers inserts (insert 1, 2 et 3) alignés sur de courts segments de résidus d’acides aminés dans HIV-1 gp120. L’insert 4 est aligné sur HIV-1 Gag. L’insert 1 (6 résidus d’acides aminés) et l’insert 2 (6 résidus d’acides aminés) dans la glycoprotéine de pointe de 2019-nCoV sont identiques à 100% aux résidus mappés sur HIV-1 gp120. L’insert 3 (12 résidus d’acides aminés) dans 2019-nCoV correspond à la gp120 du VIH-1 avec des lacunes [voir le tableau 1]. L’insert 4 (8 résidus d’acides aminés) correspond à HIV-1 Gag avec des espaces.
Pourquoi les auteurs pensent-ils que le virus est peut-être d’origine humaine? Parce que lorsqu’on regarde les insertions ci-dessus qui ne sont présentes dans aucune des familles de coronavirus les plus proches, “il est tout à fait improbable qu’un virus ait acquis de telles insertions uniques naturellement dans un court laps de temps.” Au lieu de cela, ils peuvent être trouvés dans l’identification cellulaire et les protéines de liaison à la membrane situées dans le génome du VIH.
Étant donné que la protéine S de 2019-nCoV partage l’ascendance la plus proche avec le SRAS GZ02, la séquence codant pour les protéines de pointe de ces deux virus a été comparée à l’aide du logiciel MultiAlin. Nous avons trouvé quatre nouvelles insertions dans la protéine de 2019-nCoV- «GTNGTKR» (IS1), «HKNNKS» (IS2), «GDSSSG» (IS3) et «QTNSPRRA» (IS4) (Figure 2). À notre grande surprise, ces insertions de séquence étaient non seulement absentes dans la protéine S du SRAS, mais n’ont pas non plus été observées chez aucun autre membre de la famille des Coronaviridae (figure supplémentaire). Ceci est surprenant car il est peu probable qu’un virus ait acquis de telles insertions uniques naturellement en peu de temps.
On a observé que les insertions étaient présentes dans toutes les séquences génomiques du virus 2019-nCoV disponibles à partir des isolats cliniques récents. Pour connaître la source de ces insertions dans 2019-nCoV, un alignement local a été effectué avec BLASTp en utilisant ces insertions comme requête avec tout le génome du virus. De manière inattendue, toutes les insertions ont été alignées avec le virus de l’immunodéficience humaine-1 (VIH-1). Une analyse plus approfondie a révélé que les séquences alignées du VIH-1 avec le 2019-nCoV étaient dérivées de la glycoprotéine de surface gp120 (positions des séquences d’acides aminés: 404-409, 462-467, 136-150) et de la protéine Gag (366-384 acides aminés) ( Tableau 1).La protéine Gag du VIH est impliquée dans la liaison à la membrane de l’hôte, l’empaquetage du virus et la formation de particules de type virus. Gp120 joue un rôle crucial dans la reconnaissance de la cellule hôte en se liant au récepteur primaire CD4. Cette liaison induit des réarrangements structurels dans GP120, créant un site de liaison de haute affinité pour un co-récepteur de chimiokine comme CXCR4 et / ou CCR5.
Et quelques visuels, qui amènent les auteurs de l’article à conclure que “ce changement structurel pourrait également avoir augmenté la gamme de cellules hôtes que le 2019-nCoV peut infecter” :
La modélisation 3D de la structure protéique a montré que ces insertions sont présentes au site de liaison de 2019-nCoV. En raison de la présence de motifs gp120 dans la glycoprotéine de pointe 2019-nCoV au niveau de son domaine de liaison, nous proposons que ces insertions de motifs auraient pu fournir une affinité accrue envers les récepteurs des cellules hôtes. En outre, ce changement structurel pourrait également avoir augmenté la gamme de cellules hôtes que le 2019-nCoV peut infecter . À notre connaissance, la fonction de ces motifs n’est toujours pas claire dans le VIH et doit être explorée. L’échange de matériel génétique entre les virus est bien connu et un tel échange critique met en évidence le risque et la nécessité d’étudier les relations entre des familles de virus apparemment non apparentées.
Un bon récapitulatif des résultats a été fourni par le Dr Feigl-Ding, qui a commencé son fil explicatif en soulignant que le taux de transmission hors de Chine a dépassé le taux en Chine.
Un graphique vaut mille lettres. #coronavirus . Source: NYTimes https://t.co/M1K9e6Kgz6 pic.twitter.com/evgM2UHf3U
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
2) Whoa- le taux d’augmentation *** en dehors de la Chine *** est plus raide qu’en Chine ou à Wuhan! Figure 1A. De: @TheLancet «Nowcasting et prévision de la propagation potentielle nationale et internationale de 2019-nCoV https://t.co/SwhxWGeoTj ») pic.twitter.com/u1s4SLEzMv
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
3) «On estime que 75815 personnes ont été infectées à Wuhan» -> c’est nettement plus que les rapports actuels ou ~ 10k rapports des médias chinois. (Estimation de 75k d’après l’article ci-dessus de Lancet)
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
4) … »Sur la trajectoire actuelle, le 2019-nCoV pourrait être sur le point de devenir une épidémie mondiale en l’absence de mesures d’atténuation … . ”🤢
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
Mais le “ pistolet fumant ” dans ce cas sont des morceaux du code génétique du virus que des chercheurs indiens, dirigés par Prashant Pradhan de l’Institut indien de technologie, ont découvert qu’ils pourraient avoir été “ intégrés ” au VIH, qui appartient à une famille de virus entièrement différente .
16. MISE À JOUR SUR 🦠 GENOME 🧬: un nouvel article très intrigant qui étudie le segment médian mystérieux susmentionné avec la protéine de pointe «S»: origine probable du VIH. «Similitude étrange des inserts uniques dans la protéine de pointe 2019-nCoV avec HIV-1 gp120 et Gag» de https://t.co/QAX3usr7vw pic.twitter.com/WeVA948xin
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
17. … WHOA- les auteurs ont déclaré que la découverte était «inopinément» liée aux gènes du virus VIH. Notamment, il y avait 4 insertions de gènes (voir la figure dans le post # 16 ci-dessus). Et donc, quelles protéines du gène du VIH ont été trouvées dans le nouveau #coronarvirus ? Protéine Gag et Gp120 – protéines clés du VIH … pic.twitter.com/epN66WcObj
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
18. Notamment, dans 🦠S 🧬, les auteurs disent pour les insertions du VIH: «La protéine Gag du VIH est impliquée dans la liaison à la membrane de l’hôte, l’empaquetage du virus et la formation de particules de type virus. La Gp120 joue un rôle crucial dans la reconnaissance de la cellule hôte en se liant au récepteur primaire CD4 »
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
19. Encore une fois, il s’agit de nouvelles découvertes expresses publiées qui n’ont pas encore été revues par des pairs. Ne tirons pas encore de conclusions. Mais les preuves suggèrent que 2 gènes du VIH différents 🧬 sont présents dans la région du gène #coronarvirus S (qui ne correspond à aucun autre coronavirus, selon d’autres études).
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
20. De plus, les auteurs ajoutent que «cela indique que ces insertions ont été de préférence acquises par le 2019-nCoV, ce qui lui confère un avantage supplémentaire en termes de survie et d’infectivité. En approfondissant, nous avons constaté que ces insertions étaient similaires au VIH-1. » 🤔
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
21. Des piles de papier sur: «ces 🧬insertions sont présentes au site de reliure de 2019-nCoV. En raison de la présence de motifs gp120 dans la glycoprotéine de pointe 2019-nCoV au niveau de son domaine de liaison, nous proposons que ces insertions de motifs auraient pu fournir une affinité accrue envers les récepteurs des cellules hôtes. »🤒
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
22. Les auteurs ont trempé cette conclusion finale: «Cette étrange similitude des nouveaux inserts dans la protéine de pointe 2019-nCoV avec HIV-1 gp120 et Gag est peu susceptible d’être fortuite». Wow, ils sont vraiment allés directement là-bas! 😱 Quel papier audacieux … je ne sais pas quoi dire 🤷🏻♂️ pic.twitter.com/KWcDdknMO4
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 31 janvier 2020
La punchline:
9. BOTTOMLINE: 1) Le marché des fruits de mer n’est pas la source. 2) Cet ARN #coronavirus mute très rapidement. 3) 🧬 a un segment intermédiaire inhabituel jamais vu auparavant dans aucun coronavirus. 4) Pas de mixage récent. 5) Ce segment médian mystérieux code pour la protéine responsable de l’entrée dans les cellules hôtes.
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 28 janvier 2020
Pour être sûr, le Dr Feigl-Ding insiste sur le fait qu’il n’essaye pas de promouvoir des “ complots ” sur le fait que le virus soit une arme biologique développée par les Chinois, bien qu’il soit difficile de trouver un nom approprié pour ce qui semble être un virus artificiel et armé. .
10. POUR ÊTRE CLAIR: Je ne dis absolument pas que c’est de la bio-ingénierie, et je ne soutiens aucune théorie du complot sans preuve. Je dis simplement que les scientifiques doivent faire plus de recherche et obtenir plus de données. Et trouver l’origine du virus est une priorité de recherche importante. Bonne nuit😴 pic.twitter.com/N4Yp2H8Tst
– Dr Eric Feigl-Ding (@DrEricDing) 28 janvier 2020
Un autre médecin est intervenu avec ce qu’il pensait être une explication solide des irrégularités du virus …
Dr. @ ARanganathan72 pourrait expliquer. https://t.co/zfOynizRJ6
– Shankara (@fondoflinux) 31 janvier 2020
Sûr. Le 2019-nCoV est un virus à ARN + ve brin qui pénètre dans la cellule humaine et code d’abord son ARN-réplicase pour fabriquer un ARN -ve brin qui sert de modèle pour fabriquer un ARN + ve brin qui est ensuite traduit pour sa fille nCoV. Les médicaments Lopinavir et Remdesivir ciblent sa protéase et sa réplicase.
– Anand Ranganathan (@ ARanganathan72) 31 janvier 2020
… Jusqu’à ce qu’il réalise quelque chose de dérangeant.
Oh mon Dieu. Des scientifiques indiens viennent de trouver des insertions de type virus VIH (SIDA) dans le virus 2019-nCov qui ne se trouvent dans aucun autre coronavirus. Ils suggèrent la possibilité que ce virus chinois ait été conçu [“pas fortuit”]. Effrayant s’il est vrai. Https://t.co/h6xPX1gYvj pic.twitter.com/kCpd1I00uE
– Anand Ranganathan (@ ARanganathan72) 31 janvier 2020
“Effrayant” … mais détendez-vous, c’est juste une autre “conspiration” ridicule.